Este trabajo propone un conjunto de índices denominados de Alteración Hidrológica (IAH) que permiten evaluar de manera objetiva y eficiente, los cambios que sobre los elementos del régimen de caudales con mayor trascendencia ambiental, inducen los aprovechamientos de los recursos hídricos. El proceso consta de dos fases principales encaminadas a la caracterización del régimen natural, como estado de referencia, y a la evaluación de la alteración hidrológica gracias a los IAH. El resultado final es la valoración del estatus hidrológico y la diagnosis ambiental del tramo en estudio. La metodología aquí presentada es también aplicable para identificar los aspectos del régimen de caudales que en mayor medida condicionan la rehabilitación o recuperación de un tramo regulado y para fijar criterios objetivos a la hora de establecer prioridades en la restauración de ecosistemas fluviales. Se pone pues a disposición de la comunidad científica y de los gestores de los recursos hídricos un instrumento exigido por la Directiva Marco del Agua para la caracterización del estado de las masas de agua.